Pada 30 Jun 1964, sebelum kemerdekaan, wilayah Inggeris Nyasaland, yang diganti namanya sebagai Malawi pada masa kemerdekaan, diberi lambang, yang menggantikan lencana bendera yang berasal dari penjajahan Inggeris sebelumnya. Reka bentuk baru menunjukkan macan tutul dan singa dengan perisai di antara mereka. Di perisai itu digambarkan sungai bergaya, singa, dan matahari kuning yang terbit. Moto nasional, "Kesatuan dan Kebebasan," muncul di bawah lengan, dan di bagian atas terdapat cakera kuning yang diliputi oleh helang botak.
Kuiz Menjelajah Afrika: Fakta atau Fiksyen? Tidak pernah turun salji di Kenya.Bendera kebangsaan pertama Malawi dikibarkan pada kemerdekaan, pada 6 Julai 1964. Reka bentuk bendera itu, tiga jalur mendatar sama hitam, merah, dan hijau, sesuai dengan bendera yang digunakan oleh Parti Kongres Malawi, yang kemudian menjadi kekuatan politik dominan di Negara. Garis-garis pada bendera melambangkan masing-masing rakyat Afrika di negara itu, darah para martir untuk kemerdekaan, dan sifat malawi yang selalu hijau. Nama negara itu bermaksud "perairan yang menyala-nyala," merujuk pada matahari terbenam di Danau Nyasa (dikenal di Malawi sebagai Danau Malawi), dan setengah cahaya matahari merah ditambahkan ke jalur atas bendera nasional untuk membezakannya dari bendera pesta.
Kerajaan Pres. Bingu wa Mutharika mengusulkan untuk mengubah bendera nasional, dan reka bentuk baru diadopsi pada 29 Juli 2010, dan pertama kali dikibarkan pada 7 Agustus. Jalur-jalur di bendera disusun ulang menjadi merah-hitam-hijau, dan matahari terbit yang terbit dikeluarkan . Di tempatnya muncul sinar matahari putih penuh, dengan 45 sinar terpancar darinya, berpusat di bendera. Alasan yang diberikan untuk perubahan itu adalah, sementara matahari terbenam melambangkan negara baru yang muncul, matahari penuh menandakan kematangan Malawi sebagai sebuah negara.
Bendera baru itu, bagaimanapun, tidak disukai oleh segmen besar penduduk Malawi, yang lebih menyukai bendera 1964 yang asli. Mutharika meninggal pada April 2012, dan penggantinya, Joyce Banda, berjanji untuk mengembalikan bendera lama. Parlimen Malawi memilih untuk mengembalikannya sebagai bendera kebangsaan pada 28 Mei, dan kembali digunakan.
