Ketika Soviet berkuasa di Turkestan Barat, yang menjanjikan kesetaraan dan pembangunan untuk semua etnik, orang-orang Kyrgyz memperoleh wilayah autonomi mereka sendiri pada tahun 1924. Pada tahun 1926 ia dinaikkan ke status sebuah republik yang autonomi, dan pada tahun 1936 ia menjadi sebuah kesatuan republik di USSR Pada tahun 1953, Kirgiz SSR mengadopsi versi Soviet Red Banner yang diubahsuai dengan menambahkan jalur mendatar biru bersebelahan putih melalui pusat. Setelah Kyrgyzstan mengisytiharkan kemerdekaannya pada 31 Ogos 1991, ia terus menggunakan bendera Sovietnya hingga 3 Mac 1992.
Latar belakang bendera baru, yang masih digunakan hingga kini, juga berwarna merah, tetapi ini dikatakan berasal dari bendera yang dibawa oleh pahlawan nasional Kirgiz, Manas the Noble. Di tengah bendera adalah matahari kuning dengan 40 sinar, sesuai dengan pengikut Manas dan suku yang disatukannya; sifat simboliknya yang lebih jauh adalah cahaya, bangsawan, dan kekekalan. Di atas sinar matahari itu terdapat lambang merah-kuning dengan dua set tiga garis bersilang, masing-masing di dalam cincin. Ini adalah pemandangan bergaya dari atap rumah tradisional Kyrgyz, yurt. Beberapa orang Kyrgyz masih tinggal di yurts, tetapi hingga pertengahan abad ke-20 majoriti orang nomad ini mendirikan yurts di mana sahaja mereka pergi. Makna simbolik reka bentuk ini terperinci: undang-undang bendera berbicara tentang asal usul kehidupan, kesatuan masa dan ruang, sejarah orang-orang Kyrgyz, perpaduan, dan perapian dan rumah.
