Chamorros, penduduk asli Guam, tidak menggunakan bendera, dan juga tidak ada bendera Guaman yang dibuat sementara Guam diperintah oleh Sepanyol (1521-1898). Guam berada di bawah pentadbiran AS setelah Perang Sepanyol-Amerika tahun 1898 dan secara rasmi diberi status wilayah pada tahun 1950. Kemasukan AS ke dalam Perang Dunia I mengilhami Helen L. Paul, isteri seorang pegawai tentera laut AS yang ditempatkan di Guam, untuk merancang wilayah bendera. Ini menyerupai banyak bendera negara bagian AS karena memiliki lambang (juga dibuat oleh Paul) yang berpusat di bidang biru. Bentuk lambangnya menyerupai batu katapel yang pernah digunakan oleh Chamorros untuk berburu dan bersukan. Adegan menunjukkan muara Sungai Hagåtña (Agana) dengan kelapa sawit di latar depan. Two Lovers 'Leap, tebing di latar belakang, mengingatkan kisah tradisional. Satu bentuk sampan yang dulu digunakan melengkapkan reka bentuk.
Bendera ini secara rasmi diadopsi oleh pemerintah wilayah pada 4 Julai 1917, dan dikukuhkan lagi pada 12 Mei 1931. Pasukan Jepun menduduki Guam selama hampir tiga tahun semasa Perang Dunia II. Sebagai memperingati kesusahan yang ditanggung dalam tempoh itu, sempadan merah ditambahkan pada bendera pada 9 Februari 1948.
